Добрый день. Да, как правило, при выдаче нового паспорта отметку о постоянной регистрации по месту жительства должны перенести в новый паспорт, даже если паспорт вы получаете в другом регионе, а постоянная регистрация у вас находится в прежнем регионе.
При замене паспорта подразделение МВД проверяет сведения о регистрации по своим информационным базам. Если в базе сведения о вашей постоянной регистрации есть, то штамп о регистрации должны проставить в новый паспорт при его выдаче. То, что вы обратились за заменой паспорта не по месту постоянной регистрации, само по себе не является основанием оставить паспорт без отметки о регистрации.
Но на практике иногда бывает, что сотрудники говорят: «Мы не видим регистрацию» или «ставьте штамп по месту регистрации». В таком случае нужно просить их проверить сведения по учетам МВД, а если откажут — выдать письменное разъяснение. Также возьмите с собой старый паспорт со штампом о регистрации, если он у вас на руках, и при наличии — свидетельство/справку о регистрации либо выписку из домовой книги, хотя обычно это не обязательно.
Если новый паспорт выдадут без штампа, это не означает, что регистрация прекращена. Сама регистрация сохраняется, просто отметку можно будет потом проставить через подразделение по вопросам миграции по месту жительства или через МФЦ. Но лучше сразу при получении паспорта попросить проставить отметку, чтобы потом не обращаться повторно.
Если хотите, можете обратиться в личный чат — помогу подготовить короткое обращение в ОВМ МВД на случай, если при выдаче паспорта откажутся переносить штамп о регистрации.