Могли бы вы помочь с этим вопросом?

Насколько я знаю, будь у меня эстонский паспорт, я бы мог переехать как иностранец и не делать гражданство, но по сути в моей ситуации так же должно работать, я всю жизнь прожил за границей, с рождения

Дело в том, что Вы гражданин РФ, и поэтому, если Вы собираетесь проживать в РФ — то Вам придется оформить паспорт гражданина РФ (внутренний), поскольку это основной документ удостоверяющий личность (ст. 9 Федеральный закон «О гражданстве Российской Федерации» от 28.04.2023 N 138-ФЗ)

1. Основным документом, удостоверяющим гражданство Российской Федерации и личность гражданина Российской Федерации на территории Российской Федерации, является паспорт гражданина Российской Федерации (далее также — паспорт).

2. Паспорт обязаны иметь все граждане Российской Федерации, достигшие возраста четырнадцати лет и проживающие в Российской Федерации.

Имея только российский загранпаспорт Вы фактически не сможете полноценно проживать в стране (открывать счета в банках, устраиваться на работу, приобретать недвижимость и ставит на учет транспортные средства), поскольку у Вас везде будет требовать именно паспорт удостоверяющий личность внутри РФ. Загран Вы можете использовать только для удостоверения своей личности за пределами РФ.

И с этим Вам никто помочь не сможет, поскольку таково российское законодательство.

Получение внутреннего паспорта не связано со службой в армии напрямую, но если Вы гражданин РФ, то при въезде в РФ Вы будете обязаны встать на воинский учет (ст. 10 Закона о воинской обязанности и военной службе).

И если Вам нет 30 лет и у Вас нет права на отсрочку (освобождение) от призыва, то Вы будете призваны в армию.