Геннадий, здравствуйте!
Закон № 256-ФЗ прямо разрешает использовать материнский капитал на уплату первоначального взноса и (или) погашение кредита/ипотеки на жильё, если кредит оформлен на владельца сертификата или его супруга (ст. 10 ч. 6, 8), то есть то, что заемщик и покупатель — только вы, не противоречит закону.
Правила распоряжения средствами маткапитала, утверждённые Постановлением Правительства РФ № 862, предусматривают, что право собственности может быть зарегистрировано на владельца сертификата и (или) его супруга, приобретающего жильё с использованием маткапитала, поэтому запись собственником только вас также допустима.
Заявление о распоряжении маткапиталом подаёт именно супруга как владелец сертификата, а в заявлении указывается, что стороной договора купли-продажи/заёмщиком является её супруг — это соответствует требованиям закона № 256-ФЗ и подзаконных актов.
В договоре купли-продажи обязательно должно быть указано, что часть цены уплачивается за счёт средств маткапитала по сертификату на имя супруги — у вас это условие уже выполнено, и именно оно связывает сделку с маткапиталом юридически.
СФР при проверке будет смотреть: целевой характер кредита (ипотека на приобретение жилого помещения), соответствие дома требованиям (жилой, пригоден для проживания, на территории РФ), наличие зарегистрированного права собственности на вас как супруга владельца сертификата (что допускается п. 4, 5 Правил к закону № 256-ФЗ).
После перечисления маткапитала у вас возникает обязанность оформить дом в общую долевую собственность супруги, вас и детей, с определением долей по соглашению — это прямо следует из ст. 10 закона № 256-ФЗ и разъяснений, основанных на практике Верховного Суда РФ о защите прав детей.
Поскольку дом в ипотеке, выделение долей делается с согласия банка, обычно через нотариальное соглашение/договор дарения долей и последующую регистрацию изменений в ЕГРН.
Основные ошибки, из-за которых потом возникают проблемы: неоформление долей детям и супругу, оформление «символических» долей и неполный пакет документов при обращении в СФР; сам факт, что супруга не указана покупателем, к таким ошибкам не относится.
Поэтому переделывать договор купли-продажи не нужно: достаточно, чтобы супруга подала заявление о распоряжении маткапиталом с указанием вас как заемщика/покупателя и чтобы вы в разумный срок оформили доли на всех членов семьи в соответствии с требованиями закона № 256-ФЗ и Правил распоряжения маткапиталом.
Дополнительно уточню, что формальным заявителем по распоряжению средствами материнского капитала в СФР выступает именно ваша супруга как владелец сертификата. В заявлении указывается, что стороной договора купли-продажи и заемщиком по ипотеке являетесь вы, её супруг. Подать документы фактически можно либо самой супруге, либо вам по доверенности/через личный кабинет, но распоряжение средствами оформляется от имени владельца сертификата. Это не меняет изложенный выше порядок действий и не является препятствием для перечисления средств и последующего оформления дома в общую долевую собственность семьи.