Здравствуйте!
В вашей ситуации военкомат обязан учитывать фактическое состояние здоровья, а направление на КМО в другой город не должно нарушать ваши права. Если вы не в состоянии добраться туда по медицинским показаниям, вы вправе представить письменное заявление с приложением справок от лечащих врачей, подтверждающих невозможность поездки. Военкомат в таком случае должен либо организовать комиссию по месту вашего жительства, либо обеспечить транспортировку с медицинским сопровождением. Отказ без учета этих обстоятельств можно обжаловать в вышестоящую призывную комиссию или в суд.
Не переживайте, у вас есть законное право добиваться рассмотрения дела по месту жительства, и принудить вас ехать туда, куда вы физически не можете, они не вправе.
С наилучшими пожеланиями, Хабас Феликсович.