Здравствуйте, Ирина. В описанную ситуацию верится с трудом. Именно доверенность подтверждает полномочия представителя. У вас нет даже прав предъявлять паспорт на другое лицо, неважно, сын это или посторонний человек. Паспорт действителен только при предъявлении лицом, на которое он выдан.
За многолетнюю практику я осуществляю все необходимые действия по доверенности, в т.ч., и в Росреестре. Но никогда не сталкивалась с требованием предъявить еще и паспорт доверителя. И сталкиваться с ним не должна была, т.к. такое требование грубо нарушает закон.
Либо у вас проблемы с оформлением доверенности, либо предъявленное требование — самодеятельность регистратора. Обратитесь к начальнику управления с жалобой, либо в прокуратуру.