Здравствуйте представим ситуацию Человек обучался в автошколе

В описанной ситуации аннулирование водительского удостоверения маловероятно. Вот основные аргументы:

Отсутствие состава правонарушения по КоАП РФ
Ученик находился в состоянии опьянения на теоретическом занятии, а не за рулём транспортного средства. Статья 12.8 КоАП РФ, предусматривающая лишение прав за управление в пьяном виде, в данном случае неприменима.  
Нарушение внутренних правил автошколы ≠ лишение прав
Даже если факт употребления алкоголя подтвердится, это может повлечь дисциплинарные меры со стороны автошколы (например, отчисление), но не влияет на законность выданного водительского удостоверения. ГИБДД выдаёт права на основании успешной сдачи экзаменов, а не поведения во время обучения.  pravo163.ru
Сроки предоставления информации
Если автошкола не сообщила о нарушении в ГИБДД до выдачи прав, постфактум аннулировать удостоверение по этому основанию нельзя. Для отмены решения о выдаче прав требуются веские причины (например, поддельные документы).  
Итог: Права не могут быть аннулированы за употребление алкоголя на теоретическом занятии. Однако автошкола вправе применить собственные санкции, если это предусмотрено её внутренними правилами.