Могут ли возникнуть проблемы при сдаче дел после самовольного поступления в училище?

Что имею право это понятно, но командир не принял мой рапорт, в нас было написано о том что я хочу поступить. Не получив его разрешения я сделал это самовольно. В училище мне говорят о том что я должен ехать сдавать дела и должность. Как мне быть, если они начнут грубо говоря там мутить какую то воду, допустим держать меня при казарме или вообще отправить на фронт, так же они должны мне предоставить отпуск. Вопрос о том, как с ними решать вопрос и какие приводить аргументы и могут ли они что нибудь сделать в отношении меня или же уже не имеют права так как я поступил. Да прохожу службу по контракту в мо рф, старший Сержант

Вами нарушен порядок поскольку Вы не оспорили отказ командования в соответствии с приказом МО РФ т 7 апреля 2015 г. N 185 «Об утверждении Порядка и условий приема в образовательные организации высшего образования, находящиеся в ведении Министерства обороны Российской Федерации»

55. Военнослужащие, изъявившие желание поступить в высшие военно-учебные заведения на обучение курсантами, подают рапорт на имя командира воинской части до 1 апреля года приема в вуз, а поступающие в вузы, отбор в которые производится после оформления допуска к сведениям, составляющим государственную тайну, подают рапорт на имя командира воинской части до 1 марта года приема в вуз.

Не допускается отказ в рассмотрении данных военнослужащих в качестве кандидатов в связи с отсутствием заданий, определенных планом предварительного отбора кандидатов из числа военнослужащих для комплектования первых курсов вузов.

При этом у командира части нет других вариантов с даты зачисления Вас курсантом и Вас обязаны отпустить, исключить из списков части на основании того же Приказа МО РФ 

96. Выписки из приказов Министра обороны Российской Федерации по личному составу о зачислении кандидатов в вузы и назначении их на воинские должности курсантов не позднее 7 дней после их подписания высылаются кадровым органом высшего военно-учебного заведения в главные штабы видов Вооруженных Сил, штабы военных округов, родов войск Вооруженных Сил, суворовские военные училища и военные комиссариаты субъектов Российской Федерации, направившие кандидатов в вуз.

Выписки из приказов Министра обороны Российской Федерации по личному составу о зачислении в вузы кандидатов из числа военнослужащих и назначении их на воинские должности курсантов являются основанием для их исключения из списков личного состава воинских частей.

С уважением!  Г.А. Кураев