С одной стороны проверка относится к предыдущему периоду, в котором был старый учредитель, а с другой требование налоговой о доплате НДС наступит уже при новом учредителе

Добрый день, Андрей!

По общему правилу учредителей ООО не могут привлечь к субсидиарной ответственности по долгам организаций. Однако в исключительных случаях это допустимо, например, при банкротстве (п. 2 ст. 56 ГК).

Так что кране маловероятно, что в результате налоговой проверки может возникнуть субсидиарная ответственность. И в любом случае вы должны учитывать, что такая ответственность не возникает автоматически у участника общества на какой-то момент времени. Такая ответственность вытекает из конкретных действий лица, которое привело к обязательствам, убыткам и т.п. То есть нужно еще доказать, что участник виновен. И будет привлечен именно тот участник, который был виновен, а не тот, которой значился участником в реестре на какой-либо момент времени. 

Андрей, добрый день.

Согласно ст. 3 ФЗ Об обществах с ограниченной ответственностью

1. Общество несет ответственность по своим обязательствам всем принадлежащим ему имуществом.

То есть общество в первую очередь самостоятельно отвечает по всем своим обязательствам в том числе по долгам.

Но вместе с тем в случае банкротства по вине участников возможна субсидиарная  ответственность

 3. В случае несостоятельности (банкротства) общества по вине его участников… в случае недостаточности имущества общества может быть возложена субсидиарная ответственность по его обязательствам.

Если будет доказано, что к примеру банкротство произошло по их вине. Такой подход описан в ст. 53.1 ГК РФ, ст. 61.11 Закона о банкротстве и п. 3 и 7 Постановления Пленума ВС РФ от 21.12.2017 № 53.

При этом полагаю к субсидиарной ответственности будет привлечен прежний учредитель либо иное лицо по вине которого наступило указанное обстоятельство (директор, гл. бух) если будет доказано, что банкротство произошло по его вине.

Андрей, добрый день!
При смене учредителя ООО во время налоговой проверки налоговые обязательства общества остаются за самим ООО, а не за учредителями лично. Субсидиарная ответственность учредителей возможна только при наличии оснований, предусмотренных законом, и связана с фактическим контролем и управлением обществом в период возникновения задолженности.
Налоговые обязательства ООО возникают у юридического лица и не переходят автоматически на учредителей при смене их состава (ст. 45, 46 Налогового кодекса РФ). Субсидиарная ответственность учредителей (участников) может наступить в случаях, предусмотренных ст. 56 Налогового кодекса РФ, например, при банкротстве общества, злоупотреблении правом, выводе активов и т.п. При этом учитывается, кто фактически контролировал деятельность общества в период возникновения налоговой задолженности.
Если налоговая проверка касается периода, когда был старый учредитель, но требование о доплате налогов предъявляется уже при новом учредителе, то налоговый долг остаётся за обществом. Новый учредитель не несёт субсидиарной ответственности за прошлые периоды, если не доказано его участие в неправомерных действиях. Субсидиарная ответственность может быть применена к лицам, которые фактически управляли обществом в момент возникновения задолженности, независимо от формального статуса учредителя (постановления Президиума ВАС РФ от 30.06.2015 № 1418/15).
Вывод:
— ООО несёт ответственность по налогам независимо от смены учредителей.
— Субсидиарная ответственность наступит только при наличии оснований и фактического контроля в период возникновения задолженности.
— Новый учредитель не отвечает за долги, возникшие до его вступления, если не участвовал в неправомерных действиях.

Здравствуйте! Я вам отвечу как может быть на практике. Возникновение налоговой задолженности не является основанием для привлечения к субсидиарной ответственности предыдущего и последующего руководителя или учредителя, все зависит от наличия активов для ее погашения.  При вступлении в состав учредителей вам необходимо проверить финансовое положение общества, достаточно ли обладает активами юр.лицо для погашения обязательств перед кредиторами и налоговым органом. Если активы не позволяют обеспечить погашение обязательств, то нет смысла вам вступать в состав учредителей,  так как если  должник отвечает признакам неплатежеспособности и (или) признакам недостаточности имущества то в соответствии со ст.9 Закона о банкротстве, необходимо будет подать заявление о банкротстве. В случае наступления признаков указанных в ст.9 Закона о банкротстве, и не подачи заявления о банкротстве, и продолжении деятельности усугубляющие финансовое состояние юр.лица вы можете наравне с руководителем привлечены к субсидиарной ответственности по обязательствам возникшим после наступления момента необходимости подачи заявления о банкротстве. Кроме того, основанием взыскания налоговой задолженности является решение налогового органа иди суда. Поэтому если вы вошли в состав учредителей, и вами были совершены противоправные действия по выводу денежных средств или имущества, и ваша вина будет установлена судом то васа могут привлечь к субсидиарной ответственности. Размер субсидиарной ответственности зависит от вины каждого из учредителей или руководителей в период полномочий которых были совершены действия приведшие к банкротству юр.лица либо судом были признаны сделки и платежи недействительными в период которых они были совершены.