Здравствуйте,
У Вас регистрация по месту жительства в Белгороде? А в СПб по месту пребывания зарегистрировались?
Вы должны быть зарегистрированы по месту жительства или пребывания там, где фактически проживаете. Иначе это нарушение миграционного законодательства и привлечение к административной ответственности по ст 18.8 КоАП.
www.consultant.ru/document/cons_doc_LAW_34661/535af3a253c472402638b7696485e896a7866e5a/
По поводу получения дубликата ВНЖ. Процедура получения дубликата ВНЖ регламентируется Приказом МВД России от 11 июня 2020 г. № 417 «Об утверждении Административного регламента Министерства внутренних дел Российской Федерации по предоставлению государственной услуги по выдаче иностранным гражданам и лицам без гражданства вида на жительство, замене иностранным гражданам и лицам без гражданства вида на жительство в Российской Федерации»
Для начала, Вам нужно обратиться в дежурную часть ОВД и подать заявление об утере ВНЖ. Вам дадут талон-уведомление. Он Вам будет нужен при подаче заявления на дубликата.
Затем обращаетесь в МВД по вопросам миграции по месту пребывания в СПб.
99. При утрате (хищении) вида на жительство иностранный гражданин в трехдневный срок обращается в подразделение по вопросам миграции по месту жительства (при отсутствии места жительства -по месту пребывания).
www.garant.ru/products/ipo/prime/doc/74244224/
Приказ МВД России от 11 июня 2020 г. № 417 «Об утверждении Административного регламента Министерства внутренних дел Российской Федерации по предоставлению государственной услуги по выдаче иностранным гражданам и лицам без гражданства вида на жительство, замене иностранным гражданам и лицам без гражданства вида на жительство в Российской Федерации»