Согласно заключению ВВК, у тяжелое ранение в связи с чем, со слов лечащего врача мне будет предоставлен отпуск по болезни 45 суток

Так же данные ВВК, могут быть не признаны

 А вот на это права у командования нет. Отменить заключение ВВК вправе только вышестоящая ВВК

В силу Постановления Правительства РФ от 04.07.2013 N 565  «Об утверждении Положения о военно-врачебной экспертизе»
3.На военно-врачебную комиссию возлагаются:  организация и проведение контрольного обследования и повторного освидетельствования (в том числе по результатам независимой военно-врачебной экспертизы);
контроль за обоснованностью заключений подчиненных военно-врачебных комиссий, включающий рассмотрение и утверждение (неутверждение), отмену вышестоящими военно-врачебными комиссиями заключений подчиненных военно-врачебных комиссий

Поправка, так как ВЫ отбывали наказание то применяется ст. 80.2 УК РФ

Лицо, отбывающее наказание за совершение преступления, кроме преступлений, исключение в отношении которых предусмотрено частью первой статьи 78.1 настоящего Кодекса, призванное на военную службу в период мобилизации или в военное время в Вооруженные Силы Российской Федерации либо заключившее в период мобилизации, в период военного положения или в военное время контракт о прохождении военной службы в Вооруженных Силах Российской Федерации, освобождается от наказания условно. Контроль за поведением такого лица осуществляется командованием воинской части (учреждения).