Здравствуйте Алексей!
В данном случае, с правовой точки зрения в целом законодательством не запрещено работать с поставщиком без заключения договора.
И если до выставления счета на предстоящую поставку товара договор не заключался, то при получении поставщиком оплаты по счету договор считается заключенным, если в счете содержатся все существенные для договора поставки условия, а именно определены наименование и количество товара.
А поэтому когда требования к форме договора не соблюдены, это не свидетельствует о том, что договор не заключен, если стороны достигли соглашения по всем его существенным условиям (п. 3 Постановления Пленума Верховного Суда РФ от 25.12.2018 N 49).
Соответственно ООО на НДС может закупать товар у поставщика без договора, с учетом того что счета и УПД в наличии.
Тем более любая поставка при наличии у организации оплаченного счета (соответствующего требованиям ст. 435 ГК РФ), первичного учетного документа, составленного согласно требованиям ст. 9 Закона от 06.12.2011 № 402-ФЗ «О бухгалтерском учете», счета-фактуры, оформленного в соответствии с налоговым законодательством, являются достаточными документами для налоговой инспекции.
Таким образом, с юридической точки зрения санкции не последуют.
При необходимости можете обратиться ко мне в личный чат юриста (сообщениях) для содействия, защиты и подготовке правовых документов (ст.779 ГК РФ «оказание юр.услуг»).
Всего доброго Вам!
Рад был помочь!