Если под «грязными» деньгами Вы имеете в виду денежные средства, полученные в рамках посреднических договоров, то волноваться о выборе объекта по УСН не стоит.
Согласно пп. 1 п. 1.1 ст. 346.15, пп. 9 п. 1 ст. 251 НК РФ при определении налоговой базы не учитываются в качестве доходов имущество (включая денежные средства), поступившего комиссионеру, агенту и (или) иному поверенному в связи с исполнением обязательств по договору комиссии, агентскому договору или другому аналогичному договору, а также в счет возмещения затрат, произведенных комиссионером, агентом и (или) иным поверенным за комитента, принципала и (или) иного доверителя, если такие затраты не подлежат включению в состав расходов комиссионера, агента и (или) иного поверенного в соответствии с условиями заключенных договоров. К указанным доходам не относится комиссионное, агентское или иное аналогичное вознаграждение.
Если под «грязными» деньгами Вы имеете в виду иные суммы, которые Вы не хотели бы облагать налогом, необходимо иметь в виду следующее.
Документом налогового учета, на основании которого составляется налоговая декларация является книга учета доходов и расходов (при выбранном объекте доходы может заполняться только соответствующая часть). При этом налоговый орган в рамках налоговой проверки вправе истребовать у банка выписку по счетам налогоплательщика и в случае выявления расхождений вправе (обязан) потребовать объяснений у налогоплательщика.