Какой ответственности подлежит главный бухгалтер завышающий зарплаты с целью возврата части наличными

Это ООО. Производственное предприятие. Руководитель с высоким окладом по договоренности возвращают две трети оклада и премии в кассу кассиру. По сути у нее простая тетрадь учёта. Где она галочки ставит. Как используются средства мы не знаем. Возможно далее в тендерный процедурах. Например начисляется премия 300 000 на карту 255000 я снимаю со счета и наличными несу кассиру.

Ну, если у ООО нет доли государства, то, как я говорил раньше, платите налоги и взносы с начисленных выплат, и всё будет в порядке.

В вашей ситуации проблемы обычно возникают из-за конфликтов с сотрудниками. Например, они могут задаться вопросом, почему обналичивание денежных средств проходит через них, хотя с точки зрения закона всё в порядке. Однако они не получают за это дополнительного вознаграждения.

В результате может возникнуть недовольство, конфликты, увольнения, а после жалобы в трудовую инспекцию, прокуратуру или полицию, а также в налоговую службу.

Вам предъявят необоснованное изъятие заработной платы (могут сказать, что вы угрожали  сотрудникам увольнением).

Кроме того, налоговая служба может посчитать, что вы уменьшаете налоговую базу по налогу на прибыль, и доначислит налоги и штрафы.

Главное — не ссориться с сотрудниками. Рекомендую также предусмотреть для них какие-либо бонусы от этих операций.