Здравствуйте.
В соответствии с п. 39 Положения о воинском учете, утвержденного постановлением Правительства РФ от 27.11.2006 N 719 воинский учет граждан по месту их пребывания (на срок более 3 месяцев), в том числе не подтвержденному регистрацией по месту пребывания, или месту прохождения альтернативной гражданской службы осуществляется военными комиссариатами и органами местного самоуправления в порядке, определяемом Министерством обороны Российской Федерации.
То есть, отсутствие у ВАс регистрации по месту жительства не может служить основанием для отказа в постановке на воинский учет и не освобождает Вас от обязанности на этот учет вставать.
Вы можете подать заявление лично, явившись в комиссариат (лучше распечатать 2 заявления, чтобы на втором экземпляре поставили отметку о принятии) или через Госуслуги.
В графе 4 указываете адрес ВАшего места пребывания (адрес по которому фактически проживаете)
Форму заявления прикрепляю к ответу.