Собрать их на один счет у одного человека или держать несколько счетов?

Посимо этого накопили 2 миллиона рублей, никак не задекларированный. Хочу оформить самозанятость себе и вывести их через себя.

 Илья, добрый день!  

С какой скоростью сумму можно выводить на свою самозанятость чтобы не возникло ко мне вопросов ?

 Добрый день! Есть критерий максимальной годовой вырчки по самозанятости — не более 2,4 млн. рублей в год (п.8 ст. 4   Федерального закона от 27.11.2018 N 422-ФЗ), иных ограничений по ежедневному, месячному, недельному обороту для самозанятости не установлено. Соответственно смотрите как срочно Вам понадобится эта сумма и в зависимости от этого распределяйте доходы которые будут отражатся в Вашей самозанятости. 

Как лучше держать деньги с точки зрения рисков возникновения вопросов со стороны банка/налоговой? Собрать их на один счет у одного человека или держать несколько счетов ?

Без разницы. Для самозанятости удобней использовать один счет с которого будет списываться ежемесячно налог (можно поставить автосписание)

Если я держу счет и жена держит счет, то можем ли мы переводить друг другу суммы порядка несколько миллионов? Опять же волнуют риски со стороны налоговой или вопросы от самого банка.

Можете если конечно речь не идет о проводе таких сумм через самозанятость что безусловно может вызвать вопросы

       Добрый день. С точки зрения НК у ФНС нет права начислять налоги по произведенным расходам. Таким образом напрямую  Вам налоги не начислят. При этом наличие денежных сумм для крупной покупки, а сведения о появлении у Вас объекта недвижимости в ФНС поступят,  при отсутствии задекларированного дохода в течении последних лет  может заинтересовать ФНС и послужить основанием к проведению в отношении Вас налоговой проверки. Результат будет зависеть уже от тех доказательств что ФНС сможет в ее ходе собрать.

    В данном случае, дабы избежать вопросов со стороны ФНС следует подумать о схемах легализации Ваших средств, поскольку при выявлении неоплаченных налогов возможны применения мер как налоговой( ст.119, 122 НК, пеня по ст 75 НК) так и, при достижении пределов установленных УК — мер уголовной ответственности по ст. 198 УК www.consultant.ru/document/cons_doc_LAW_10699/e270bffc924c8d102ca5740e5b8c405a451734a8/

     Варианты  легализации возможны разные, но юристам запрещено в рамках правил сайта давать консультации по нарушению закона. То что указываете Вы, легализация через тот же НПД( доход до 2.4 млн.руб. в год) на практике существует, но это далеко за рамками законных действий. Существуют и иные варианты.При этом средства Вы можете занять, Вам их могут подарить, это с точки зрения ФНС будет законным вариантом.

     Все остальные  моменты, в т.ч. схемы легализации, поскольку нюансов масса,   могут быть детально разобраны в рамках отдельной полноценной услуги в чате( кнопочка рядом с фото юриста, доступна при входе на сайт через браузер)

С уважением Евгений Беляев