Лишение стипендии

Добрый день! Хочу проконсультироваться относительно такой ситуации. Я прохожу интернатуру за счет средств федерального бюджета, и по 4х стороннему договору между мной, учебным заведением, министерством здравоохранения и больницей, где я в дальнейшем буду работать, указанно что мне должны выплачивать государственную стипендию в установленном порядке. Но после полугодовой аттестации, меня и части моих коллег лишили стипендии, в связи с неуспешной ее сдачей. Но дело в том что такие новшества ввели только в этом году, и система оценивания была неполноценна, так как среднюю оценку за аттестацию вывели по двум оценкам, из необходимых трех. Прошу ответить, имеет ли руководство медицинской академии лишить интернов стипендии, и как следует поступать в дальнейшем.