Работаю на двух кафедрах: на одной по основному месту работы и на другой по внутреннему совместительству

Здравствуйте Елена.

Вы видимо имеете ввиду отпуск без сохранения заработной платы, так как в настоящее время в рамках трудового законодательства РФ предусмотрен именно такой отпуск, а не административный как ранее.

Далее я продолжу в следующем ответе ниже подробнее.

Здравствуйте, Елена! 

Речь идёт именно о длительном отпуске без сохранения заработной платы для педагогических работников, на который они имеют право раз в 10 лет

Работа по совместительству (гл. 44 ТК РФ) — это работа по отдельному трудовому договору и используя отпуск по основному месту работы, Вы не обязаны брать отпуск по месту работы по совместительству (это Ваше право, если Вы сможете работать по совместительству).

Поэтому не вижу препятствий, если, находясь в отпуске в соответствии с Приказом Министерства образования и науки РФ от 31 мая 2016 г. N 644, Вы будете работать по совместительству.

Согласно п. 1 Постановления Минтруда РФ от 30 июня 2003 г. N 41 «Об особенностях работы по совместительству педагогических, медицинских, фармацевтических работников и работников культуры» Вы  вправе осуществлять работу по совместительству  на условиях трудового договора в свободное от основной работы время:

по месту их основной работы или в других организациях, в том числе по аналогичной должности, специальности, профессии,