Добрый день! Полагаю, что сделать такое соглашение нельзя. Потому как в силу закона предусмотрено именно то что вы хотите изменить.
ст 287.5 ГК РФ
Доля собственника помещения, машино-места в праве собственности на общее имущество в здании или сооружении пропорциональна доле общей площади принадлежащих ему помещения, машино-места в общей площади здания или сооружения.
Собственник помещения, машино-места не вправе отчуждать свою долю в праве собственности на общее имущество в здании или сооружении, а также совершать иные действия, влекущие передачу этой доли отдельно от права собственности на принадлежащие ему помещение, машино-место. Выдел в натуре доли собственника помещения, машино-места в праве общей собственности на общее имущество в здании или сооружении не допускается.
При отчуждении помещения, машино-места к их новому собственнику переходит соответствующая доля в праве собственности на общее имущество в здании или сооружении.
Полагаю, манипуляция с уменьшением или увеличение доли в общем имуществе без увеличения доли в самом помещении незаконна. После продажи помещения новый собственник может не согласится с этим соглашением и оспорить, к примеру.
про общее имущество в нежилом здании можно почитать в определении Верховного Суда Российской Федерации от 11.12.2018 N 11-КГ18-31
С 01.10.2023 года пункт 5 статьи 287.5 ГК РФ утратит свою силу и будет действовать Федеральный закон от 24.07.2023 N 351-ФЗ «О внесении изменений в часть первую Гражданского кодекса Российской Федерации», которым в ГК РФ вводится, в частности, статья 259.2.
Согласно этой статьи будет также определено, что доля в праве общей собственности на общее имущество, принадлежащая собственнику одной недвижимой вещи, пропорциональна площади принадлежащей ему соответствующей недвижимой вещи. Но при этом с оговоркой: «если иное не установлено законом».
То есть по общему правилу так и будет, что размер доли в праве общей собственности на здание пропорционален размеру общей площади принадлежащего ему помещения в общей площади здания.