Не будет ли это проблемой при возмещении денег?

В соответствии с ч. 1 ст. 325 ТК РФ

Лица, работающие в организациях, расположенных в районах Крайнего Севера и приравненных к ним местностях, имеют право на оплату один раз в два года за счет средств работодателя стоимости проезда и провоза багажа в пределах территории Российской Федерации к месту использования отпуска и обратно. Право на компенсацию указанных расходов возникает у работника одновременно с правом на получение ежегодного оплачиваемого отпуска за первый год работы в данной организации.

По своему предназначению данная компенсация расходов сотрудника на оплату стоимости проезда к месту проведения отпуска и обратно является дополнительной гарантией реализации им своего права на ежегодный оплачиваемый отпуск, а также позволяет такому сотруднику провести свой отпуск за пределами районов Крайнего Севера.  При этом в ст. 325 ТК РФ не указано, каким образом сотрудник должен оплачивать билеты на проезд к месту отдыха и обратно. Исходя из содержания статьи можно сделать вывод о том, что расходы по оплате проезда к месту проведения отпуска и обратно подлежат возмещению в том случае, если оплата за такой проезд произведена самим работником. 

Исходя из разъяснений, изложенных в п. 7 Обзора судебной практики ВС № 2 за 2016 г., утв. Президиумом ВС РФ от  06.07.2016 г., работодатели небюджетных организаций, осуществляющие  экономическую деятельность в районах Крайнего Севера, вправе в рамках коллективного трудового договора или отдельного локального нормативного акта устанавливать размер, условия и порядок предоставления работникам компенсации расходов на оплату стоимости проезда к месту использования отпуска и обратно.