Гражданин РФ въехал в Азербайджан по паспорту США, въехать в Россию хочет по загр паспорту РФ, как на контроле в РФ отнесутся к этому?

Эмиль, добрый день.

Да никак не отнесутся. 

Законодательство РФ не регулирует правила въезда граждан РФ на территорию иностранных государств, оно регулирует только порядок въезда и выезда из/в РФ. Да и не может регулировать, так как суверенитет РФ действует только на ее территории.

В соответствии со ст.6 Федерального закона от 15.08.1996 N 114-ФЗ  «О порядке выезда из Российской Федерации и въезда в Российскую Федерацию».

Выезд из Российской Федерации и въезд в Российскую Федерацию граждане Российской Федерации осуществляют по действительным документам, удостоверяющим личность гражданина Российской Федерации за пределами территории Российской Федерации

Здравствуйте.

Главная обязанность гражданина РФ — въезд в РФ и выезд из РФ по паспорту гражданина РФ. Это прямо определено ст. 6 Федерального закона от 15.08.1996 N 114-ФЗ  «О порядке выезда из Российской Федерации и въезда в Российскую Федерацию», согласно которой

Выезд из Российской Федерации и въезд в Российскую Федерацию граждане Российской Федерации осуществляют по действительным документам, удостоверяющим личность гражданина Российской Федерации за пределами территории Российской Федерации

А как именно Вы действуете за пределами РФ и по каким документам пересекаете другие границы, для российских органов непринципально.

Если Вам потребуется дополнительная консультация по этому вопросу и/или составление документов, либо возникнут иные правовые вопросы, Вы можете обратиться ко мне в чат за персональной консультацией.

въехать в Россию хочет по загр паспорту РФ, как на контроле в РФ отнесутся к этому?

Как раз именно так он и имеет права въехать в РФ. Являясь гражданином РФ, въезжать в РФ и выезжать из РФ он имеет права только по заграничному паспорту РФ в силу ст.6 ФЗ «О порядке выезда из Российской Федерации и въезда в Российскую Федерацию» от 15.08.1996 N 114-ФЗ

http://www.consultant.ru/document/cons_doc_LAW_11376/4c954ec2d6576479d0ab89f51734ea04f770f7f2/

В ином случае, гражданин РФ может быть привлечён к ответственности по ст 18.1 КоАП

rulaws.ru/amp/koap/Razdel-II/Glava-18/Statya-18.1/

Как он вьезжал в Азербайджан пограничников РФ не интересует. 

Поэтому, все впорядке. Въезжать в РФ нужно именно по заграну РФ.