Здравствуйте, Александр.
Теперь заставляют в отпуск идти по очереди
это право работодателя, потому что именно он составляет и утверждает график отпусков, который обязателен как для работника, так и для работодателя (ст. 123 ТК РФ). Если ни вы, ни Ваш коллега не относитесь к льготным категориям работников, которым отпуск предоставляется в удобное для них время, работодатель может Ваши пожелания не учитывать при составлении графика отпусков.
А вот что касается замены вами и коллегой друг друга, то тут работодатель Вас и его не вправе заставлять работать за находящегося в отпуске. У Вас обоих должен быть установленный режим рабочего времени (ст. 100 ТК РФ), изменить который произвольно работодатель не может, кроме случаев, указанных в ст. 74 ТК РФ с соблюдением установленного там порядка. Вас не могут без Вашего согласия привлекать к работе в Ваши выходные дни, так что все равно работодателю придется нанимать кого-то на подмену отсутствующего работника.