Правомерно ли это и куда обращаться?

Добрый вечер.

О каких заболеваниях идет речь?

Можете выложить заключение по результатам его обследования? 

Добры вечер Екатерина. 

Согласно п.1 ст. 7 Федерального конституционного закона от 4 октября 2022 года № 6-ФКЗ «О принятии в Российскую Федерацию Луганской Народной Республики и образовании в составе Российской Федерации нового субъекта — Луганской Народной Республики»

Со дня принятия в Российскую Федерацию Луганской Народной Республики и образования в составе Российской Федерации нового субъекта военнослужащие, проходящие военную службу в Народной милиции Луганской Народной Республики,воинских формированиях и органах Луганской Народной Республики, продолжают проходить военную службу в соответствии с законодательством Российской Федерации до урегулирования в установленном законодательством Российской Федерации порядке вопроса о заключении указанными военнослужащими контрактов о прохождении военной службы при условии их соответствия требованиям, предъявляемым законодательством Российской Федерации к гражданам, поступающим на военную службу по контракту, или об увольнении с военной службы. Указанные военнослужащие имеют установленный законодательством Российской Федерации статус военнослужащих, проходящих военную службу по контракту. 

Т.е. на Вашего отца распространяются нормативные документы Российской Федерации о порядке прохождения военной службы, в том числе о годности к военной службе. 

Согласно п. 5 Положения о военно-врачебной экспертизе, утв. Постановлением Правительства РФ от 04.07.2013 г. № 565 заключение военно-врачебной комиссии выносится открытым голосованием простым большинством голосов присутствующих на заседании членов комиссии.

Правомерно ли это и куда обращаться ?

Что бы говорить о правомерности действий комиссии по определению годности Вашего отца к военной службе, необходимо знать результаты обследования, установленный диагноз. 

Ваш отец, при наличии к тому оснований, в соответствии с п. 8  Положения о военно-врачебной экспертизе  может обжаловать вынесенное военно-врачебной комиссией  в отношении его заключение в вышестоящую военно-врачебную комиссию  или в суд,