Здравствуйте! Командировка является уважительной причиной. Поэтому Вы можете обратиться в военкомат по месту регистрации после возвращения из командировки с предоставлением документов о командировки с печатью работодателя.
Статья 7. Ответственность граждан и должностных лиц за нарушение настоящего Федерального закона Федерального закона от 28.03.1998 N 53-ФЗ «О воинской обязанности и военной службе»
2. Уважительными причинами неявки гражданина по повестке военного комиссариата при условии документального подтверждения причины неявки являются:
иные причины, признанные уважительными призывной комиссией, комиссией по первоначальной постановке на воинский учет или судом.
Ответственности никакой в Вашем случае не будет, так как Вы во время вручения повестки находились не по месту регистрации и постановки на военный учет.
А так предусмотрена административная ответственность КоАП РФ Статья 21.5. Неисполнение гражданами обязанностей по воинскому учету.
влечет предупреждение или наложение административного штрафа в размере от пятисот до трех тысяч рублей.
Вот свежие разъяснения по вопросу. Ссылка