Если доли в квартире выделяются детям и супругу, то такое соглашение будет содержать признаки брачного договора, в связи с чем должно быть удостоверено нотариально в соответствии со ст. 42 СК РФ.
Т.к. законным режимом имущества супругов является режим совместной собственности согласно ст. 34 СК РФ, изменение данного режима на долевую собственность возможно только путем заключения соглашения о разделе по ст. 38 СК РФ или путем заключения брачного договора по ст. 42 СК РФ.
Т.к. в квартире, купленной с использованием мат.капитала, выделяются доли всем членам семьи, у квартиры будет долевой режим собственности, в связи с чем соглашение о выделении долей надо нотариально удостоверять.
В простой письменной форме соглашение о выделении долей составляется только в случае, когда доли выделяются владельцем сертификата только детям.