Здравствуйте, Елена. Если дом не зарегистрирован в государственных органах, он просто документально не существует. Его нельзя купить, продать или сдать в аренду без официальных договоров и регистрации. Соседи или те же государственные органы могут в судебном порядке признать дом самовольной постройкой и обязать вас снести его. Регистрация жилого дома обязательна.
Единственная официальная зарегистрированная собственность. На которой вы (что уже и сделали) можете построить любые нужные вам постройки (но дом надо зарегистрировать и признать жилым).
При продаже участка со всеми необходимыми документами рисков нет. Если покупателей устроит нахождение на участке дома, то они купят участок по стоимости участка вместе с домом. Если не устроит, они или как собственники участка снесут дом, или поставят вам условие снести дом.
Если участок в официальной собственности (за него платятся налоги, им владеют и распоряжаются на основании регистрации в ЕГР), то срок приобретательной давности тут роли не играет (она может быть 5 или 15 лет).