Вы не только имели право, но и были обязаны подписать приемопередаточный акт, в случае, если контрагент по сделке исполнил свои обязательства в полном объеме. Вы являетесь законным представителем юрлица. Ответственность по сделке несет само юрлицо своим имуществом.
Касательно ответственности самого руководителя. Ст.4 Закона "об Обществах с ограниченной ответственностью", предусматривает таковую, если ущерб обществу причинен виновными действиями руководителя. Иск о возмещении ущерба может быть подан участником общества или сами обществом. В этом случае истцу придется доказывать Вашу вину в причинении обществу ущерба, а в Вашей ситуации, отсутствие обязанности подписывать акты, что, как я понимаю, будет очень сложно для истца, если все было в порядке со стороны контрагента, и общество, в соответствии с действующим законодательством, вправе было заключать такую сделку. (Тут надо смотреть ситуацию по документам.)
Кроме того существует уголовная и административная ответственность руководителя. Ввиду неизвестности сделки, о которой идет речь, приведу некоторые статьи, касательно сделок и их исполнения: 146, 171.1, 174, 176, 179, 193, 194, 195-197, 199, 199.1, 199.2. В КоАПе - за преднамеренное и фиктивное банкротство, нарушение в области предпринимательской деятельности, нарушение законодательства о рекламе. Можно разобраться подробнее: andreyfrolov78@mail.ru