Можно ли разобраться в этом вопросе спустя 3 года?

В соответствии со ст. 137 ТК РФ из заработной платы работника возможно удержание для возврата сумм, излишне выплаченных работнику вследствие счетных ошибок, но только при соблюдении работодателем следующих условий, установленных в абз. 2 ст. 137 ТК РФ:

работодатель вправе принять решение об удержании из заработной платы работника не позднее одного месяца со дня окончания срока, установленного для возвращения аванса, погашения задолженности или неправильно исчисленных выплат, и при условии, если работник не оспаривает оснований и размеров удержания.

Если указанные условия соблюдены, то удержание излишне выплаченных сумм в соответствии с ч. 1 ст. 138 ТК РФ производится в размере не более 20 % начисленной заработной платы при каждой ее выплате.

Если хотя бы одно из этих условий не соблюдено (работник оспаривает удержание или истек месячный срок), работодатель теряет право на удержание данных сумм.