Добрый день.
ГК РФ Статья 506. Договор поставки
По договору поставки поставщик-продавец, осуществляющий предпринимательскую деятельность, обязуется передать в обусловленный срок или сроки производимые или закупаемые им товары покупателю для использования в предпринимательской деятельности или в иных целях, не связанных с личным, семейным, домашним и иным подобным использованием.
После выявления недопоставки должен быть составлен акт с подписями ответственных лиц. Минимум в 2 экземплярах
После этого между продавцом и покупателем должны пройти переговоры по этому поводу.
Вижу два варианта.
1. возврат денежных средств в сумме соответствующей количеству недопоставки.
2. Зачет этой суммы в счет будущих поставок, то есть за следующую поставку будет уплачено меньше.
В принципе, это возможно оговорить в доп соглашении.