Как нам быть в данной ситуации и куда обращаться?

Здравствуйте Анастасия! 

В данном случае, должна быть предоставлена отсрочка на срок до 6 месяцев, поскольку ИМТ менее 18,5 для лечения и обследования. При выявлении заболеваний, препятствующих призыву на военную службу, возможно и освобождение от прохождения военной службы, для этого необходимо ознакомиться с медицинскими документами, которые у Вас имеются. Кроме того, в военном комиссариате обязаны принимать документами из любых медицинских учреждений, которые имеют лицензию.

Если врач в военном комиссариате занижает диагноз и вопреки установленным требованиям ставит категорию годности Б-3, необходимо обжаловать данное решение врачу, руководящему медицинской комиссией, либо в Министерство здравоохранения, либо в суд. 

Если Вам необходима дополнительная консультация либо помощь в составлении письменных документов, можете обратиться в мой чат, по правилам сайта услуги в чате платные.
Всего доброго!

День добрый.

Пищевая аллергия на продукты входящие в довольствие военнослужащих дает право на освобождение от службы в армии. 

Если нужно освободиться от службы в армии, то я помогу реализовать право на освобождение от призыва по имеющимся основаниям. 

Так же в соответствии с пп. «а» п. 1 ст. 23   Федерального закона от 28.03.1998 N 53-ФЗ  «О воинской обязанности и военной службе»
1. От призыва на военную службу освобождаются граждане:
а) признанные ограниченно годными к военной службе по состоянию здоровья;
Так же согласно п. 1 ст. 52 ФЗ № 53 – ФЗ «О воинской обязанности и военной службе». 
Запас Вооруженных Сил Российской Федерации создается из числа граждан:
не прошедших военную службу в связи с освобождением от призыва на военную службу;   
Согласно Приказа Минобороны РФ и Минздрава РФ от 23 мая 2001 г. N 240/168 «Об организации медицинского обеспечения подготовки граждан Российской Федерации к военной службе»  
Обоснованность освобождения призывников или предоставления им отсрочек от призыва на военную службу по состоянию здоровья проверяется путем изучения врачами — членами призывной комиссии субъекта Российской Федерации  всех  медицинских документов, подтверждающих установленный диагноз и вынесенное заключение.
В соответствии с Положением о военно-врачебной экспертизе утвержденным  постановлением Правительства РФ от 04 июля 2013 года № 565 

Обращайтесь — помогу.