Здравствуйте!
Проблема в том, что у вас при разделе участка получилось два новых участка (ст.11.4 Земельного кодекса РФ), о чем свидетельствует изменение кадастрового номера, а срок владения новым участком считается с даты регистрации права собственности — это общее правило, которое применимо к вашей ситуации. Поэтому-то налоговая и требует от вас налог.
Но размер налога вы можете уменьшить (или даже обнулить) одним из двух способов:
1. Имущественный налоговый вычет, когда налог считается только с суммы сверх 1 млн. руб.
Статья 220. Имущественные налоговые вычеты
1) имущественный налоговый вычет предоставляется:в размере доходов, полученных налогоплательщиком в налоговом периоде от продажи жилых домов, квартир, комнат, включая приватизированные жилые помещения, садовых домов или земельных участков или доли (долей) в указанном имуществе, находившихся в собственности налогоплательщика менее минимального предельного срока владения объектом недвижимого имущества, установленного в соответствии со статьей 217.1 настоящего Кодекса, не превышающем в целом 1 000 000 рублей;
2. Путем зачета расходов на покупку участка, когда налог считается с разницы между ценой при покупке и ценой при продаже.
Статья 220. Имущественные налоговые вычеты
2) вместо получения имущественного налогового вычета в соответствии с подпунктом 1 настоящего пункта налогоплательщик вправе уменьшить сумму своих облагаемых налогом доходов на сумму фактически произведенных им и документально подтвержденных расходов, связанных с приобретением этого имущества.