Добрый день София. В Вашей ситуации, с целью избегания вопросов, связанных с законностью распоряжения площадями здания, переданного Вам в безвозмездное пользование, наиболее оптимальным будет вариант заключения с банком договора «обслуживания» в условия которого будет прописан пункт, что Банк принимает на себя обязательство по оказанию Вашему предприятию услуги по выдаче наличных денежных средств через банкомат, установленный на территории предприятия.
Далее, установку Банкомат оформить Актом об установке оборудования.
Таким образом это избавит Вас от необходимости заключения с Банком каких либо иных форм договоров, по которым имеется необходимость фактического предоставления в аренду помещения (его части) собственником которого Ваша организация не является.
Если договор уже заключен, то оформить размещение банкомата можно путем заключения доп. соглашения
Могу привести положительной пример из судебной практики, когда требование собственника помещения (контролирующего органа), о незаконности действий гос. учреждения, в части распоряжения имуществом и предоставления его под банкомат было отклонено.
Постановление Арбитражного суда Западно-сибирского округа по делу № № А27-24635/2014 от 25.09.2015 г.
Указанный документ можно найти в сети интернет в открытом доступе.
Надеюсь мой ответ помог Вам!