Уважаемый Кирилл! Доброго! В силу абзаца 1 п.1 ст.145 НК РФ (см. http://www.consultant.ru/cons/...)
Организации и индивидуальные предприниматели, за исключением организаций и индивидуальных предпринимателей, применяющих систему налогообложения для сельскохозяйственных товаропроизводителей (единый сельскохозяйственный налог), имеют право на освобождение от исполнения обязанностей налогоплательщика, связанных с исчислением и уплатой налога (далее в настоящей статье — освобождение), если за три предшествующих последовательных календарных месяца сумма выручки от реализации товаров (работ, услуг) этих организаций или индивидуальных предпринимателей без учета налога не превысила в совокупности два миллиона рублей.
При этом (абзац 1 п.5 ст.145 НК РФ):
Если в течение периода, в котором организации и индивидуальные предприниматели, указанные в абзаце первом пункта 1 настоящей статьи, используют право на освобождение, сумма выручки от реализации товаров (работ, услуг) без учета налога за каждые 3 последовательных календарных месяца превысила 2 миллиона рублей либо если налогоплательщик осуществлял реализацию подакцизных товаров, налогоплательщики начиная с 1-го числа месяца, в котором имело место указанное превышение либо осуществлялась реализация подакцизных товаров, и до окончания срока освобождения утрачивают право на освобождение.
и далее (абзац 3 п.5 ст.145 НК РФ):
Сумма налога за месяц, в котором имело место указанное выше превышение либо осуществлялась реализация подакцизных товаров, подлежит восстановлению и уплате в бюджет в установленном порядке.
НДС с доходов свыше 2 миллионов рублей Вам в любом случае надо уплачивать в любом случае (см. ст.166 НК РФ). при этом же (абзац 3 п.1 ст.172 НК РФ):
Вычеты сумм налога, предъявленных продавцами налогоплательщику при приобретении либо уплаченных при ввозе на территорию Российской Федерации и иные территории, находящиеся под ее юрисдикцией, основных средств, оборудования к установке, и (или) нематериальных активов, указанных в пунктах 2 и 4 статьи 171 настоящего Кодекса, производятся в полном объеме после принятия на учет данных основных средств, оборудования к установке, и (или) нематериальных активов.
Далее
В июне покупает апартаменты у юрлица как ОС для сдачи в аренду (25 млн, в т.ч НДС 20% =5 млн руб), и в этом же месяце продает другую квартиру в новостройке по переуступке с прибылью (разница цена покупки и продажи) 2 млн руб, в т.ч. НДС 20%=400тр, ввиду этого слетает с освобождения от НДС и хочет возместить у государства 5-0,4=4.4 млн руб.
Далее, смотрим ст.ст.171,172, 176,176.1 НК РФ.
апартаменты за счет каких средств приобрели?
то же самое и по квартире?
апартаменты приобретаются в ипотеку.
квартира продается по переуступке.