Здравствуйте, Анна!
Вам нужно обратиться с соответствующим заявлением о возврате денежных средств, зачисленных на депозитный счет суда в суд, который вынес определение об оставлении заявления без рассмотрения.
В заявлении указать, что Вами вносились денежные суммы на финансирование процедуры банкротства, согласно платежному поручению или квитанции (их тоже необходимо приложить к заявлению), в связи с оставлением заявления без рассмотрения указанные суммы должны быть возвращены Вам, а также указать реквизиты для возврата денежных средств.
Суд по аналогии со ст. 178 АПК РФ вынесет определение, по которому Вам и вернут денежные средства.
Во вложении примерный образец заявления, правда в нем речь идет о возврате встречного обеспечения, но его можно адаптировать под конкретно Вашу ситуацию.
Актуальная. Там нет ничего такого, что могло бы поменяться со временем.