Подскажите меня какие то органы могут оштрафовать или закрыть магазин, за то, что нет документов на собственность?

Здравствуйте, Артур.

Если на строительство магазина не получено разрешение, то местная администрация может заставить Вас по решению суда снести его как самовольную постройку (ст.222 Гражданского кодекса). 

Также могут наложить штраф по статье 9.5 КоАП:

Строительство, реконструкция объектов капитального строительства без разрешения на строительство в случае, если для осуществления строительства, реконструкции объектов капитального строительства предусмотрено получение разрешений на строительство, —

влекут наложение административного штрафа на граждан в размере от двух тысяч до пяти тысяч рублей; на должностных лиц — от двадцати тысяч до пятидесяти тысяч рублей; на лиц, осуществляющих предпринимательскую деятельность без образования юридического лица, — от двадцати тысяч до пятидесяти тысяч рублей или административное приостановление их деятельности на срок до девяноста суток; на юридических лиц — от пятисот тысяч до одного миллиона рублей или административное приостановление их деятельности на срок до девяноста суток.

Поэтому если нет разрешения на строительство, то надо через суд его узаконивать.

Если же магазин не капитальное строение, а нестационарный торговый  объект, то на его установку разрешение не требуется, и Вы вправе установить его на своем земельном участке, если вид разрешенного использования участка или местные правила землепользования и застройки допускает это. Если, например, у Вас участок под размещение жилого дома, а Вы там устроили магазин, то могут наложить штраф по ст.8.8 КоАП РФ.

Это основные риски.

С уважением, Роман.