Или лучше выбрать другую систему налогообложения?

Вадим, здравствуйте. Патент будет один, но по общему правилу чтобы рассчитать стоимость патента, надо учитывать потенциально возможный доход ИП, установленный в вашем регионе, и налоговую ставку. Если же торговых объектов несколько, стоимость патента будет равна произведению потенциально возможного дохода, количества торговых точек и ставки налога за патент.

Для того, чтобы подобрать вам оптимальную налоговую систему нужно провести некоторую работу по изучению ваших показателей, что в рамках бесплатной консультации невозможно. 

Если вам интересна данная услуга, обращайтесь.