Анна, здравствуйте!
1. Без разницы. Вести хозяйственную деятельность может как ИП, так и ООО. У ООО и ИП разные условия ответственности, сдачи отчетности и т.д. Тут смотрите что Вам удобнее. С авторским правом это не связано.
2. Если Вам нужны именно доли в бизнесе, то нужно регистрировать ООО на 3 учредителей в тех пропорциях в которых договоритесь. Инвесторы должны будут заключать с ООО договоры инвестирования в бизнес. Банкротство в договоре не прописывается, оно на основании закона происходит.
Про выход сторон из сделки: если речь идет о выходе инвестора, то в договоре инвестирования этот момент надо прописывать, если же Вы имеете ввиду учредителя — тогда в учредительном договоре особенности выхода нужно указывать.
Методики обучения можно зарегистрировать в рамках патентного права если они уникальны, после чего с обладателем патента заключить лицензионный договор на использование. Далеко не все методики регистрируют в качестве изобретения, поэтому нужно внимательно изучать что там за методика.
ГК РФ Статья 1350. Условия патентоспособности изобретения
1. В качестве изобретения охраняется техническое решение в любой области, относящееся к продукту (в частности, устройству, веществу, штамму микроорганизма, культуре клеток растений или животных) или способу (процессу осуществления действий над материальным объектом с помощью материальных средств), в том числе к применению продукта или способа по определенному назначению.
Если остались какие-то вопросы, а также если Вам необходимо подготовить какие-либо документы — пишите мне в личные сообщения.