Здравствуйте, Татьяна.
Исходя из смысла и содержания:
Федеральный закон от 29.07.2017 N 217-ФЗ (ред. от 03.08.2018) «О ведении гражданами садоводства и огородничества для собственных нужд и о внесении изменений в отдельные законодательные акты Российской Федерации»
Статья 17. Компетенция общего собрания членов товарищества
1. К исключительной компетенции общего собрания членов товарищества относятся:
5) принятие решения о создании (строительстве, реконструкции) или приобретении имущества общего пользования, в том числе земельных участков общего назначения, и о порядке его использования;
Из писем Минфина России следует, что многолетние насаждения относятся к основным средствам и являются движимым имуществом. Таким образом, полагаю, что решение о судьбе деревьев должно быть принято на общем собрании СНТ. Удачи.