Обязан ли я возвращать деньги, которые перевели за командировку после увольнения?

Добрый вечер Никита!

Да, Вы обязаны вернуть эти деньги в противном случае они могут быть взысканы с Вас в судебном порядке как неосновательное обогащение.

ГК РФ Статья 1102. Обязанность возвратить неосновательное обогащение  1. Лицо, которое без установленных законом, иными правовыми актами или сделкой оснований приобрело или сберегло имущество (приобретатель) за счет другого лица (потерпевшего), обязано возвратить последнему неосновательно приобретенное или сбереженное имущество (неосновательное обогащение), за исключением случаев, предусмотренных статьей 1109 настоящего Кодекса.

2. Правила, предусмотренные настоящей главой, применяются независимо от того, явилось ли неосновательное обогащение результатом поведения приобретателя имущества, самого потерпевшего, третьих лиц или произошло помимо их воли.

Кроме того с вас взыщут судебные расходы  и процент за пользование чужими денежными средствами ст. 395 ГК РФ.

Вернуть их можно любым удобным Вам способом.