Как действовать, если работодатель отказывается оплатить фактически отработанное время без ТД?

Здравствуйте. Можете обратиться в инспекцию по труду и прокуратуру. При этом конечно желательно, чтобы были свидетели или документы любые, которые подтверждают, что Вы исполняли поручение работодателя.  Работодателю следует иметь в виду, что согласно ст. 67 ТК РФ

Трудовой договор, не оформленный в письменной форме, считается заключенным, если работник приступил к работе с ведома или по поручению работодателя или его уполномоченного на это представителя. При фактическом допущении работника к работе работодатель обязан оформить с ним трудовой договор в письменной форме не позднее трех рабочих дней со дня фактического допущения работника к работе, а если отношения, связанные с использованием личного труда, возникли на основании гражданско-правового договора, но впоследствии были признаны трудовыми отношениями, — не позднее трех рабочих дней со дня признания этих отношений трудовыми отношениями, если иное не установлено судом.