Снять с регистрационного учета

Согласно

Постановлению Правительства РФ от 17 июля 1995 г. N 713
"Об утверждении Правил регистрации и снятия граждан Российской Федерации с регистрационного учета по месту пребывания и по месту жительства в пределах Российской Федерации и перечня должностных лиц, ответственных за регистрацию" п.31 п.п."ж"

Снятие с регистрационного учета гражданина возможно только на основании вступившего в законную силу решения суда о выселении или прекращения права пользования жилым помещением.

Так что более правильным будет подача искового заявления о прекращении права пользования жилым помещением. Где Вы и укажете о наличии другого жилого помещения, где может проживать Ваша мать, можно также, указать что отказ ее в добровольном порядке прекратить пользоваться Вашей квартирой существенно нарушает Ваши права, по распоряжению данной квартирой, а именно по ее продаже( затрудняет ее продажу т.к. Ваша собственность обременена правами др. лица).

Другой возможный, но более сложный,вариант решения проблемы: продать квартиру с обременением( вряд ли покупатель согласится на такую покупку), затем также в судебном порядке, согласно п.2 ст. 292 ГК РФ прекратить право пользования жилым помещением:

"...2. Переход права собственности на жилой дом или квартиру к другому лицу является основанием для прекращения права пользования жилым помещением членами семьи прежнего собственника, если иное не установлено законом".