Добрый день.
Согласно п. 4 ст. 218 ГК РФ Член жилищного, жилищно-строительного, дачного, гаражного или иного потребительского кооператива, другие лица, имеющие право на паенакопления, полностью внесшие свой паевой взнос за квартиру, дачу, гараж, иное помещение, предоставленное этим лицам кооперативом, приобретают право собственности на указанное имущество.
Если Вы сами выплачивали паевые взносы на строительство, то Ваше право собственности возникло с момента полной выплаты пая, независимо от регистрации в ЕГРН. Исходя из данных которые Вы написали Вы стали членом ГСК позднее, уже после его строительства и выплаты паевых взносов. Поэтому Вам скорее всего и отказали. Если есть возможность выложите сюда отказ в регистрации,. для того чтобы оценить шанс на его оспаривание и законность его вынесения.
реестр ссылается на список от председателя который он давал в россерестр, если тебя в списке нет то и регистрации не будет, регистрируют тех кто в списке ГСК