Как получить налоговый вычет с покупки жилья, если не удается восстановить чеки?

Скорее всего, строительная организация лукавит, так как у организаций есть обязанность хранить кассовые документы в течение четырех (согласно Налоговому кодексу) — пяти лет (согласно Федеральному закону «О бухгалтерском учете»). В то же время законодательство не возлагает обязанность на юридические лица по выдаче дубликатов данных документов по запросу контрагента. Поэтому в вашем случае можно только очень сильно просить их войти в ситуацию.