Здравствуйте, Виктор!
Согласно ч.1 ст. 706 ГК РФ если из закона или договора подряда не вытекает обязанность подрядчика выполнить предусмотренную в договоре работу лично, подрядчик вправе привлечь к исполнению своих обязательств других лиц (субподрядчиков). В этом случае подрядчик выступает в роли генерального подрядчика.
В описанном Вами случае субподрядной организацией по отношению организации 2 выступает организация 3. Сейчас организация 3 хочет получать денежное вознаграждение от организации 1, которая является генеральным подрядчиком по отношению к организации 2. Для этого необходимо провести переговоры с организацией 1, отказаться от исполнения договора с организацией 2, с компенсацией подрядчику произведенных затрат и заключить договор с организацией 1
А если, через договор цессии??
В любом случае нужно проводить переговоры. Если получиться уговорить первую организацию стать Вашим финансовым агентом, то может быть.