Как мне уволиться с должности генерального директора в ООО?

Согласно ст. 80 Трудового Кодекса РФ работник имеет право расторгнуть трудовой договор, предупредив об этом работодателя в письменной форме не позднее чем за две недели, если иной срок не установлен настоящим Кодексом или иным федеральным законом. Течение указанного срока начинается на следующий день после получения работодателем заявления работника об увольнении.

По соглашению между работником и работодателем трудовой договор может быть расторгнут и до истечения срока предупреждения об увольнении.

Таким образом, Вам необходимо направить заявление учредителю в письменной форме  его заказным письмом с уведомлением и описью вложения. Если не придете к согласию расторгнуть договор раньше срока, то отработайте положенное время и можете не выходить на работу. Отказать в увольнении по собственному желанию Вам не имеют права!