Анна!
В данном случае, судя по всему, налоговый орган отказывает Вам в возможности уменьшить налогооблагаемую базу (доходы от продажи квартир) на сумму произведённых Вами расходов на ремонт квартир.
Действительно, возможность включения каких-то конкретных видов расходов, связанных с приобретением недвижимости в состав расходов, уменьшающих налогооблагаемую базу налогоплательщика прямо Налоговым Кодексом не предусмотрена, есть только указание на общую возможность учёта таких расходов.
Отсутствие конкретики в данном случае позволяет налоговым органам трактовать закон по своему усмотрению, явно не в интересах налогоплательщика.
Но Вы не первая в такой ситуации и этот вопрос уже был предметом рассмотрения Конституционного суда РФ по заявлению налогоплательщика (Определение №1220-О от 16.07.13).
Конституционный суд указал, что отсутствие конкретики в данном случае — вполне нормальная ситуация, что невозможно предусмотреть всё многообразие случаев, когда гражданин понёс расходы при приобретении жилья, а потому необходимо разбираться в каждом отдельном случае:
В соответствии с абзацем вторым подпункта 1 пункта 1 статьи 220 Налогового кодекса Российской Федерации при определении размера налоговой базы по налогу на доходы физических лиц налогоплательщик вправе уменьшить сумму своих облагаемых налогом доходов на сумму фактически произведенных им и документально подтвержденных расходов, связанных с получением этих доходов.
При этом тот факт, что законодатель не предусмотрел перечень конкретных расходов, связанных с приобретением квартиры, которые могут быть учтены налогоплательщиками при определении размера налоговой базы, нельзя рассматривать как ограничение их прав. Такое регулирование направлено на предоставление налогоплательщикам возможности в каждом конкретном случае, исходя из особенностей их экономической деятельности, учесть любые необходимые фактически произведенные и документально подтвержденные расходы, связанные с приобретением в собственность жилой недвижимости, с учетом многообразия видов таких расходов.
Для Вас это означает, по большому счёту, — всё, что не запрещено, то разрешено. Вам ничто не мешает обжаловать решение налогового органа в установленном порядке и требовать учёта расходов на ремонт квартир в счёт уменьшения доходов от их продажи.
Спасибо, для более подробной консультации обращусь попозже