Здравствуйте!
не знаю о каких изменениях ФНС Вам сказал, т.к. 2014г. действовала такая же норма, что и сейчас — транспортный налог уплачивается по месту жительству (месту пребывания) физ. лица, а не месту регистрации ТС.
Статья 363. Порядок и сроки уплаты налога и авансовых платежей по налогу
1. Уплата налога и авансовых платежей по налогу производится налогоплательщиками в бюджет по месту нахождения транспортных средств.
по ст.83 НК
Местом нахождения имущества в целях настоящей статьи признается:
...
2) для транспортных средств, не указанных в подпунктах 1 и 1.1 настоящего пункта, — место нахождения организации (ее обособленного подразделения) или место жительства (место пребывания) физического лица, по которым в соответствии с законодательством Российской Федерации зарегистрировано транспортное средство;
поскольку транспортный налог — это региональный налог, то уплачивайте налог, а уплаченный в другом регионе налог Вы можете вернуть подав заявление по ст.78 НК (главное не пропустить срок в 3 года).
