Алексей, добрый день!
В ФЗ «О гособоронзаказе» предусмотрены исключения для таких операций. Так что из прямого толкования норм закона произвести такие выплаты со счецсчета можно.
Ниже нормы:
Статья 8.4. Операции, совершение которых по отдельному счету не допускается
3) перечисление (выдача) денежных средств физическим лицам, за исключением:
а) оплаты труда при условии одновременной уплаты соответствующих налогов, страховых взносов в Пенсионный фонд Российской Федерации, Фонд социального страхования Российской Федерации, Федеральный фонд обязательного медицинского страхования;
б) денежных выплат, связанных с предоставлением работникам гарантий и компенсаций, предусмотренных Трудовым кодексом Российской Федерации (за исключением компенсаций расходов на проезд и найм жилого помещения);
9) исполнение исполнительных документов, за исключением исполнительных документов, предусматривающих:
… б) перечисление (выдачу) денежных средств для расчетов по выплате выходных пособий лицам, работающим или работавшим по трудовому договору (контракту), и (или) по оплате их труда;
Однако обращаю внимание: практики судебной пока мало и она неоднозначная!