Здравствуйте!
В законодательстве ограничений по количеству проверяющих одновременно ведомств нет. Когда составляются планы проверок, то все они в обязательном порядке направляются в прокуратуру для согласования. Если прокуратура видит, что одну и ту же организацию запланировали два разных проверяющих ведомства в разное время, то рекомендует этим ведомствам состыковать время проверок. Все исходит из принципа, что все проверяющие госорганы придут проверить в один месяц, чем целый год каждый месяц по одному будут приходить по одному проверяющему ведомству.
Но запрещается проверять разным контролирующим органам по одним и тем же вопросам (т.е. каждый проверяет вопросы своего ведомства). Например, трудовое законодательство планово пришла проверить прокуратура, а через две недели проводится проверка трудовой инспекцией или военный учет проверила прокуратура, а потом пришел военкомат. Федеральный закон от 26 декабря 2008 года № 294-ФЗ «О защите прав юридических лиц и индивидуальных предпринимателей при осуществлении государственного контроля (надзора) и муниципального контроля».