Что делать, если нарушены сроки публикации по 44-ФЗ?

Отписаться уже никак не получится, т.к. протоколы об административных правонарушениях уже составлены и дела возбуждены. Избежать штрафа не получится, т.к. в сфере гозакупок срок привлечения к ответственности составляет один год, поэтому даже если по каким-то формальным основаниям в первый раз не привлекут к ответственности, то у уполномоченного органа будет более чем достаточно времени, чтобы устранить нарушения и попытаться повторно привлечь виновных к ответственности.

Единственный способ хоть как-то сгладить ситуацию — доказать, что это произошло не по вине тех, на кого составлены протоколы, а по каким-то непредвиденным, непреодолимой силы обстоятельствам. На моей практике еще никого не освобождали от реальных нарушений, в этом плане там все строго. Можете попытаться сослаться на малозначительность (т.к. эти документы на ход закупок уже не влияли, равно как и на выбор исполнителя, поэтому общественно опасными не являются, негативных последствий не повлекли, а наказание несоизмеримо с негативными последствиями, которые повлекли данные нарушения).