Положены ли выплаты по беременности и родам директору ООО?

Конечно положены. Не надо путать с акционерами или участниками общества. Директор является таким же работником, как и все остальные. Не важно при этом если он учредитель или акционер.   Главное, чтобы он состоял в штате, за него платили страховые взносы, НДФЛ. Выплата пособий, отпуска производятся в таком же порядке, как и остальным работникам. Даже если в трудовом контракте существуют положения, ущемляющие права директора, руководствоваться следует нормами трудового законодательства.